Основное представление о генофонде кумжи

Учебные материалы по биологии / Использование микросателлитного анализа ДНК для изучения популяций кумжи (Salmo Trutta L.) в реках Абхазии / Основное представление о генофонде кумжи

Страница 4

Интересно, что на территории Пиренейского полуострова найдены три из пяти названных выше филогенетических линий мтДНК, а также группа эндемичных гаплотипов (Suarez et al., 2001; цит. по : Алтухов, 2004). Очевидно, что именно в этом рефугиуме сохранились остатки наиболее древних популяций кумжи, обладающих максимальным генетическим разнообразием, о чём свидетельствуют данные и по аллозимам (Sanz, 2000; цит. по: Алтухов, 2004), и по мтДНК (Weiss et al., 2000; Suarez et al., 2001; цит. по: Алтухов, 2004). При существующем антропогенном давлении перспективы дальнейшего выживания этих популяций проблематичны, если не будут приняты специальные меры для охраны этого уникального генофонда (Алтухов, 2004).

Кумжа, как уже отмечалось, ─ один из наиболее изученных и изучаемых в популяционно-генетическом плане видов рыб, на котором отрабатывается применение новейших молекулярных методов анализа изменчивости (Ferguson et al.,1995; цит. по: Алтухов, 2004). Именно для групп популяций кумжи из разных участков ареала, изучавшихся по аллозимным генам, получены оценки межпопуляционной генетической изменчивости (FST) на основе полиморфизма фрагментов мтДНК и минисателлитных локусов. Сравнение показывает, что оценки FST по аллозимным и минисателлитным локусам весьма сходны, но могут оказаться как сходными, так и отличающимися от оценок FST по мтДНК (с учётом гаплоидности митохондриального генома) (Ferguson et al.,1995; Laikre et al., 1995; Estoup et al., 1998; цит. по: Алтухов, 2004).

Оценки FST, полученные для популяций кумжи по отдельным минисателлитным локусам (селективно нейтральные участки генома), довольно близки между собой, как и должно быть для нейтральных маркеров (Ferguson et al.,1995; цит. по: Алтухов, 2004). Следовательно, и усреднённый по многим аллозимным генам величины FST, будучи сходными с соответствующими величинами по минисателлитам, также могут рассматриваться как оценки уровня селективно нейтральной дифференциации. Но величины FST, полученные по отдельным аллозимным генам, в отличие от оценок по минисателлитам, варьируют гораздо сильнее, что, очевидно, служит указанием на разнообразие селективной значимости аллозимных генов (Алтухов, 2004).

Наконец, приведём для кумжи усреднённые по регионам величины основных популяционно-генетических показателей: величина общего генного разнообразия НТ = 0,0837, величина внутрипопуляционного генного разнообразия (HS) равна 0,0526 и величина межпопуляционного генного разнообразия (GST) составляет 37,10 (Алтухов, 2004). Для сравнения приведём аналогичные показатели для других видов лососевых (табл. 3) (Алтухов, 2004).

Таблица 3. Усреднённые по регионам величины общего генного (НТ), внутрипопуляционного (НS) и межпопуляционного (GST) разнообразия.